感染性疾病科创建于1957年，是我院最早成立的学科。曾参加我国新一代抗疟药青蒿素及其衍生物治疗疟疾的研究，1978年获全国科学大会奖。1986年成为硕士学位招生点，2013年成为博士学位招生点。2003年成立人工肝室，近年开创的少量血浆PE联合PDMAS组合人工肝技术全国领先，2018年成为全国疑难及重症肝病公关协作组及中华医学会重肝与人工肝学组“全国人工肝及血液净化技术示范中心”。在复旦大学医院管理研究所公布的2014-2019年度西南区医院专科声誉排行榜中，我科排名西南区第四，云南省第一。是云南省卫健委突发公共卫生事件、重大传染病、艾滋病及新发传染病危重症的定点收治单位，承担着专科、本科、研究生及MBBS留学生的传染病学教学。感染性疾病科VCT（医疗卫生机构艾滋病自愿咨询检测）门诊成立于2009年，负责我院艾滋病咨询、确诊、治疗工作，为国家消除艾滋病做出了积极的贡献。

感染性疾病科大楼建筑面积5400平方米，现有床位120张，人工肝室5张病床并具备负压病房功能，5楼具有独立的IICU病房和功能齐备的负压病房。科室有21名医师，38名护士。其中主任医师9名，副主任医师5名，博士6名，在读博士1名，硕士及以上20余名，其中护理硕士2名，在读护理硕士3名。

为了提高全省艾滋病护理专业水平及服务质量，使更多优秀的艾滋病专科护士充实临床一线，我科于2014年申报成立了“云南省艾滋病专科护士培训基地”，旨对全省医疗机构、区县各级医疗机构中从事艾滋病护理工作的护理人员进行理论知识、临床实践技能的培训，让从事艾滋病护理工作、护理管理工作的护理人员掌握艾滋病护理所必需的理论知识、专科技能、心理、人文等多学科的相关知识，并具备相关操作的熟练技能。培训班全程脱产学习包括理论教学和临床教学两种形式，理论教学160学时（8学时×5天×4周）和临床教学实践160学时（8学时×5天×4周）。每期均邀请艾滋病领域中资深的医疗、护理专家进行授课。截止目前共培养省内艾滋病专科护士9人。