昆明医科大学第一附属医院内科消化学组始建于20世纪50年代，由消化内科留学美国归来的姚蓬心教授首创，在学科奠基人姚蓬心教授大力倡导和带领下，1950年在国内率先引进并开展硬式胃镜诊疗，随后在姚蓬心教授、陈耀明教授、文家蓉教授和贾友兰教授的共同努力下，于1973年率先开展纤维胃、肠镜检查。1987年正式建立消化内科，为我省首批被国家教育部批准的消化病学硕士和博士学位授予点。经过历任科主任（文家蓉教授、周曾芬教授、段丽平教授、缪应雷教授）的不懈努力，团队不断开拓和创新，现消化内科已被国家卫生健康委员会评为国家临床重点专科、国家住院医师重点规培基地（内科学）、国家临床医学研究中心-云南省分中心、云南省临床医学研究中心、云南省消化病研究所、云南省工程技术研究中心、云南省消化疾病创新团队、沈祖尧院士工作站、云南省消化内科专科联盟理事长单位等。

消化内科现有在职医师44人，护士87人，其中高级职称人员12人，博导4人，硕士生导师9人，博士21人，硕士19人，国家百千万人才工程人选1人、国家有突出贡献中青年专家1人，享受国务院政府特殊津贴1人，云南省中青年学术技术带头人3名，云岭学者1人、云岭名医5人，青年拔尖人才3人，云南省有突出贡献优秀专业技术人才2名，享受省政府特殊津贴3人，获得云南省青年科技奖1人。是云南省医学会消化病学分会-主任委员单位，中华医学会消化病分会委员1人、青年委员1人，中华医学会各学组成员11人。我科目前呈现一院多区格局，现有3个病区、在编床位173张；消化内科日均门诊人数600余人次，月均出院人数900人次以上，其中，我科接诊云南省90% 以上的炎症性肠病患者，已成为云南省最大的肠道疾病诊治中心，率先在省内开展粪菌移植新技术的研究及临床运用，成功制备“彩云”系列粪菌胶囊，为优化粪菌移植方案提供依据。在肝病方面，组建多学科合作团队，致力于开发新药，服务于临床，对脂肪性肝病、自身免疫性肝病、肝硬化等临床常见病有独到的诊治方法。在消化内镜方面，率先在20世纪80年代开展了ERCP技术。现有3个内镜诊疗区，面积达3500平方米，是云南省规模最大的消化内镜诊疗中心，每年内镜诊疗数量超过10万余例，微创手术达到近2万台次，其中ERCP术500余例，ESD术500余例，POEM术300余例，超声内镜2000余例，以及其他所有内镜下的治疗工作。此外，消化道早癌诊治特色突出、成效显著。我科也大力发展胰腺疾病、功能性胃肠病、幽门螺杆菌感染等疾病的特色诊治，并取得了卓越的成绩。

近年来，主持获得国家自然科学基金17项(其中重点项目1项、面上项目2项)，省级项目20项，获得省政府科技进步奖一等奖2项，三等奖11项，以第一作者和通讯作者发表SCI文章70余篇，其中2021及2023年在Gastroenterology （影响因子：33.883）发表3篇论著，2020年在Cell Host & Microbe（影响因子：31.678）发表1篇论著，出版专著20余部，参编人民卫生出版社《内科学》及《诊断学》（第10版），获批专利14项，新技术24项，参编指南10余项。