全科医学科成立于2014年，2019年独立成科，2020年成立全科教研室，是云南省医学会全科分会主任委员单位。早在2011年即成为云南省首家也是唯一的全科硕士学位授予点，2012年成为云南省全科医师规范化培训基地，2014年获首批国家级全科住院医师规范化培训基地，同时是云南省全科转岗培训基地，云南省继续医学教育基地。在复旦大学医院管理研究所公布的2020及2021年度西南地区全科医学声誉排行榜中位列第四，云南省第一。

科室拥有一支高素质人才队伍，有博士4人，硕士10人。医师12人，护士19人，其中主任医师3人，副主任医师2人，主治医师5人，住院医师2人。目前开放病床总数50张，主要收治内分泌代谢疾病、未分化疾病、多种慢性病共存及疑难危重患者。科室设有独立的全科医学门诊。全科门诊配有两间独立诊室，开设全科专家门诊、普通门诊及特色专病门诊，特色专病门诊包括：内分泌高血压专病门诊、钙磷代谢专病门诊及慢病专病管理、未分化疾病及中西医结合糖尿病专病门诊，拥有内分泌高血压及代谢性骨病两个亚专业，在云南率先开展肾上腺静脉取血术（AVS），2020年成立内分泌高血压联盟。

科室长期承担昆明医科大学、海源学院本科临床专业内科学、诊断学、全科医学大课讲授，参与昆明医科大学MBBS留学生《老年病》全英文大课讲授及见习教学。常年承担昆明医科大学全科、临床、检验、眼视光专业等学生的实习带教工作，每年接收实习学生近200人。作为国家全科住院医师规范化培训基地，每月规范开展教学查房、小讲课、病案讨论、线上讲堂，并设有技能月月练、读书报告会、全科思维训练及健康讲堂等特色教学，基地每周均到社区医院指导教学及医疗工作，并建立了分级诊疗及双向转诊的通道。近3000余平米“全科技能训练中心”即将投入使用。

基地参编了国家十三五、十四五住培规划教材《全科医学》的编写，负责云南省全科研究生教学案例库项目建设，获校级教研教改项目5项。对教学工作的重视获得丰硕成果，国家住培结业考核一考通过率逐年提升，近三年均为100%。科室多名教师荣获省级、院级优秀专业基地主任、优秀带教老师及昆明医科大学三育人先进个人。连续两年在中国医师协会主办的“全科专业住院医师规范化培训指导医师教学查房和教学门诊技能竞赛”中，荣获二等奖、三等奖。

科室在专业期刊发表论文100余篇，SCI收录论文20余篇。主持或参与国家级自然科学基金项目研究8项，省科技厅、省教育厅、昆医联合专项、省卫生厅等省级科研项目20余项，与社区卫生服务中心联合开展慢性病防治研究。科室是云南省老年疾病与主动健康工程研究中心、国家老年疾病临床医学研究中心（解放军总医院）云南省分中心、云南省代谢性疾病临床医学研究中心核心成员。