国家临床重点专科建设项目4个：
| 批准时间 | 重点专科名称 | 申报科室 | 专科负责人 | 联络员 |
| 2010 | 产科 | 产科 | 马润玫 |
|
| 2011 | 心血管内科 | 心脏内科 | 郭 涛 |
|
| 2012 | 皮肤科 | 皮肤科 | 何 黎 |
|
| 2013 | 急诊医学科 | 急诊科 | 钱传云 |
|
国家中医药管理局“十二五”重点专科（国家中医重点专科）建设项目1个：
| 批准时间 | 重点专科名称 | 申报科室 | 专科负责人 | 联络员 |
| 2012 | 风湿病科 | 中医科 风湿免疫科 | 张 颖 | 王文婷 |
云南省省级临床重点专科建设项目24个：
| 批准时间 | 重点专科名称 | 申报科室 | 专科负责人 | 联络员 |
| 2011 | 神经外科 | 神外一、神外二 | 杨智勇 | 邓兴力、马江平 |
| 2011 | 临床护理 | 护理部 | 田 莹 | 徐渝娟 |
| 2011年获得2个省级临床重点专科建设项目 | ||||
| 2013 | 神经内科 | 神经内科 | 钟莲梅 | 刘泫彦彰 |
| 2013 | 精神科 | 精神科 | 许秀峰 | 陈 融 |
| 2013 | 肾病科 | 肾脏内科 | 周 竹 | 李 青 |
| 2013 | 重症医学科 | 急诊科、ICU | 钱传云 | 李 波 |
| 2013 | 耳鼻喉头颈外科 | 耳一、耳二 | 阮 标 | 张洁琳 |
| 2013 | 骨科 | 骨科、运动 | 赵学凌 | 张 源 |
| 2013 | 呼吸内科 | 呼二、呼一 | 戴路明 | 周莎莎 |
| 2013年获得7个省级临床重点专科建设项目 | ||||
| 批准时间 | 重点专科名称 | 申报科室 | 专科负责人 | 联络员 |
| 2014 | 血液内科 | 血液内科 | 曾 云 | 黄 颖 |
| 2014 | 老年病科 | 干疗科 | 白松 / 杨秋萍 | 杨红菊 |
| 2014 | 医学影像科 | 影像科、放疗科、核医学科 | 赵 卫 | 易根发 |
| 2014 | 普通外科 | 普外一二三四五、肿瘤外科、移植科、干外 | 王昆华 / 罗华友 | 施承民 |
| 2014 | 泌尿外科 | 泌外一、泌外二、移植科 | 申吉泓 | 陈跃龙 |
| 2014 | 麻醉科 | 麻醉科 | 邵建林 | 王 全 |
| 2014 | 肿瘤科 | 乳腺外科、肿瘤内科、放疗科 | 蒋爱梅 | 董 苑 |
| 2014年获得7个省级临床重点专科建设项目 | ||||
| 批准时间 | 重点专科名称 | 申报科室 | 专科负责人 | 联络员 |
| 2015 | 新生儿专业 | 儿科 | 梁 琨 | 段 江 |
| 2015 | 感染病科 | 感染性疾病科 | 李 武 |
|
| 2015 | 免疫科 | 风湿免疫科 | 徐 健 |
|
| 2015 | 医学检验科 | 检验科 | 段 勇 |
|
| 2015 | 运动医学科 | 运动医学科 | 李彦林 |
|
| 2015 | 临床药学科 | 临床药学科 | 张 峻 |
|
| 2015年获得6个省级临床重点专科建设项目（含2个省院共建项目） | ||||
| 批准时间 | 重点专科名称 | 申报科室 | 专科负责人 | 联络员 |
| 2016 | 眼科 | 眼科 | 李 燕 |
|
| 2016 | 消化内科 | 消化内科 | 缪应雷 |
|
| 2016年获得2个省级临床重点专科培育项目 | ||||
