呼吸与危重症医学科于1987年在医院大内科呼吸专业组基础上独立建科，是云南省最早独立建科的呼吸内科。2018年11月为适应学科发展需要更名为呼吸与危重症医学科。是呼吸病学硕士研究生招生点、全国首批专科医师PCCM（呼吸与危重症医学）试点培训基地。是中国医师协会呼吸医师分会、中华医学会呼吸病学分会、全国呼吸专科医联体、国家呼吸疾病医疗质控中心，共同认证的“在呼吸与危重症医学科规范化建设项目”中被认定为“PCCM三级医院优秀单位”。呼吸与危重症医学专修基地，RICU/MICU、呼吸治疗、肺功能单修基地。国家呼吸临床研究中心、中日医院呼吸专科医联体单位、中日医院呼吸专科医联体单位危重症协作组成员单位。全国肺栓塞与肺血管病防治协作组成员单位。中国医师协会“西部呼吸介入联盟”理事长单位。中国肺癌防治联盟肺结节诊治分中心、LCBP肺癌早诊示范中心。卫生部临床药师呼吸内科专业培训基地。获得国家食品药品监督管理局认证的“药物临床试验机构资格”。由中共云南省委组织部、云南省科学技术厅、云南省财政厅、云南省人力资源和社会保障厅设立的云南省院士（专家）工作站首都医科大学北京朝阳医院RICU孙兵专家工作站在我科建站。科室先后获得中共云南省委云南省人民政府授予的“云南省抗击新冠肺炎疫情先进集体”、中共云南省委高校工委“规范化建设示范党支部”、昆明市总工会的“昆明市工人先锋号”、共青团昆明医科大学委员会“青年文明号”，多次获得昆明医科大学第一附属医院先进集体、中共昆明医科大学第一附属医院党委职业道德先进集体、“三强”党支部、优秀团支部等荣誉。

科室设有3个医疗护理单元及功能室，包括呼吸综合病房、呼吸ICU病房、支气管镜检查室、支气管镜介入中心、肺功能检查室。年平均门诊量5万余人次，年平均住院3千余人次。现有职工59人，其中医生22名，护士34名，技师1名，科研研究员1名，秘书1名。主任医师、教授5名，副主任医师、副教授6名、主治医师5名；副主任护师2名；主管护师9名。硕士研究生导师5人，80%医生拥有硕士及以上学历，博士8名，护士均具有本科以上学历。多年来医护先后前往美国、澳大利亚、泰国及国内著名医院研修学习，形成了一支业务过硬、作风踏实、服务优质、精诚团结的优秀团队。科室护理团队秉持“严谨、奉献、创新、和谐”的精神，以精湛的专业技术服务于患者，获得“全国优质护理服务示范病房”及我院“标杆病房”称号，连续多年被评为“优秀管理科室”，多次荣获“优秀带教团队”称号。多名学科骨干入选云南省中青年学术和技术带头人后备人才、云南省医学后备人才、昆明医科大学 “百名中青年学术和技术骨干”。获得云南省科技进步二等奖等科研奖励6项。获得国家专利发明授权10余项。获得国家自然科学基金、云南省科技厅、教育厅等科研立项20余项。发表SCI等专业期刊论文100余篇，主编和副主编及参编人民卫生出版社、云南省科技出版社等专著10余部。主要诊断治疗内科和呼吸系统的常见病、多发病及疑难危重疾病，如：呼吸衰竭、急性呼吸窘迫综合症、肺栓塞、肺癌、良恶性气道狭窄、难治性哮喘、肺部感染、慢阻肺、肺心病、间质性肺疾病、胸腔积液、气胸等。对呼吸系统疑难危重症疾病的诊治水平，居云南省领先，西部较前列。在云南省率先构建气道支架置入、硬质支气管镜、光动力等技术结合全身综合精准和个体化肺癌治疗体系；建立胸部影像学AI技术、肺癌早诊生物标志物、荧光支气管镜、导航系统及ROSE平台等技术的肺癌早期诊断的预测体系；构建了靶向治疗、支气管热成型术等规范化诊疗难治性哮喘的难治性哮喘诊疗体系。